NRNB 專案

本頁詳細說明 Google 文件季度接受的一項技術撰寫專案詳細資料。

專案摘要

開放原始碼組織：

國家網路生物學資源 (NRNB)

技術撰稿人：

kozo2

專案名稱：

將 GUI 控制教學課程替換為 Jupyter Notebook 和 R Markdown

專案長度：

標準長度 (3 個月)

Project description

https://github.com/cytoscape/cytoscape-tutorials/wiki 取得不少教學資源，但大部分教學課程都是以 GUI 為基礎，而非在 Python 或 R 中自動執行。

我會盡可能使用 Python 和 R 撰寫 Cytoscape 教學課程的內容，並製作 Jupyter Notebook 和 R Markdown 圖庫網站。 這些網站的設計看起來會像這樣：https://plot.ly/ipython-notebooks/ 和 https://rmarkdown.rstudio.com/gallery.html。

為了維持新內容的一致性，我會使用持續整合服務和 https://github.com/cytoscape/docker-cytoscape-desktop (自動執行 Jupyter Notebook 和 R Markdown)。