MDAnalysis 專案

本頁詳細說明 Google 文件季度接受的一項技術撰寫專案詳細資料。

專案摘要

開放原始碼組織：

MD 分析

技術撰稿人：

lilyminium

專案名稱：

依主題分類的使用手冊

專案長度：

長期跑步 (5 個月)

Project description

MDAnalysis 程式庫指南與 API 參考資料不同，包括：

1. 用於 MDAnalysis 資料結構的詳細指南。本頁將介紹 Atom、AtomGroup 以及 Universe 類別，包括 I/O 選項，以及操控 Atoms 及結合 AtomGroups 的相關資訊。

2. Analytics (分析) 構成要素上的頁面。任何使用者定義分析均以 AnalysisBase 類別、 AnalysisFromFunction 類別和 analytics_class 函式。每個類別在背景執行的工作都值得知道，例如類似 numpy.vectorize。

3. 使用 Universe.select_atoms 選取原子群組的網頁。實行此做法背後的技術細節和分子動態知識。

4. 拓撲說明頁面。使用者應瞭解建構系統的資料結構、用法、操弄和架構。

5. 顯示可用視覺化方法的頁面，適用於資歷和目前傳回的資料以視覺化方式呈現的分析。