Progetto MDAnalysis
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Questa pagina contiene i dettagli di un progetto di documentazione tecnica accettato per la stagione della documentazione di Google.
Riepilogo del progetto
- Organizzazione open source:
- MDAnalysis
- Technical Writer:
- lilyminium
- Nome del progetto:
- Una guida dell'utente strutturata per argomento
- Durata del progetto:
- A lungo termine (5 mesi)
Project description
Una guida alla libreria MDAnalysis, separata dal riferimento all'API, che include:
Una guida dettagliata alle strutture di dati utilizzate in MDAnalysis. Questa pagina illustra le classi Atom, AtomGroup e Universe, include le opzioni di I/O e contiene informazioni sulla manipolazione degli atomi e sulla combinazione di AtomGroup.
Una pagina sui componenti di base di Dati. La classe AnalysisBase, la classe AnalysisFromFunction e le funzioni analysis_class formano la base di qualsiasi analisi definita dall'utente. È interessante sapere che cosa fa ogni classe dietro le quinte, ad esempio se è analogo a numpy.vectorize.
Una pagina sulla selezione di gruppi di atomi utilizzando Universe.select_atoms. Sia i dettagli tecnici che le conoscenze di dinamica molecolare alla base del modo in cui viene implementata.
Una pagina sulle topologie. Gli utenti devono comprendere la struttura, l'utilizzo, la manipolazione e il framework dei dati per la creazione di sistemi.
Una pagina sui metodi di visualizzazione disponibili, sia per la traiettoria che per le analisi correnti che restituiscono dati per la visualizzazione.
Salvo quanto diversamente specificato, i contenuti di questa pagina sono concessi in base alla licenza Creative Commons Attribution 4.0. Per ulteriori dettagli, consulta le norme del sito di Google Developers. Java è un marchio registrato di Oracle e/o delle sue consociate.
Ultimo aggiornamento 2024-11-08 UTC.
[[["Facile da capire","easyToUnderstand","thumb-up"],["Il problema è stato risolto","solvedMyProblem","thumb-up"],["Altra","otherUp","thumb-up"]],[["Mancano le informazioni di cui ho bisogno","missingTheInformationINeed","thumb-down"],["Troppo complicato/troppi passaggi","tooComplicatedTooManySteps","thumb-down"],["Obsoleti","outOfDate","thumb-down"],["Problema di traduzione","translationIssue","thumb-down"],["Problema relativo a esempi/codice","samplesCodeIssue","thumb-down"],["Altra","otherDown","thumb-down"]],["Ultimo aggiornamento 2024-11-08 UTC."],[[["This project aims to create a comprehensive user guide for the MDAnalysis library, focusing on topics like data structures, analysis tools, atom selection, topologies, and visualization methods."],["The guide will provide detailed explanations of key MDAnalysis classes such as Atom, AtomGroup, Universe, and AnalysisBase, along with practical examples of their usage."],["This long-running project will complement the existing API reference by offering a more user-friendly and topic-oriented approach to understanding MDAnalysis."],["It will empower users to effectively utilize the library for molecular dynamics analysis by providing clear guidance on data manipulation, analysis customization, and visualization techniques."]]],["The core of this project involves creating a user guide for the MDAnalysis library. This guide will include detailed explanations of MDAnalysis data structures like Atom, AtomGroup, and Universe, covering I/O and manipulation. It will detail the underlying AnalysisBase and AnalysisFromFunction classes, alongside `Universe.select_atoms` functionality. The project also covers topologies, focusing on structure, usage, and system construction. Lastly, it will detail trajectory and analysis data visualization methods.\n"]]
