Halaman ini berisi detail proyek penulisan teknis yang diterima untuk Google Season of Dokumen.
Ringkasan proyek
- Organisasi open source:
- MDAnalysis
- Penulis teknis:
- liliminium
- Nama proyek:
- Panduan pengguna yang disusun berdasarkan topik
- Durasi proyek:
- Jangka panjang (5 bulan)
Project description
Panduan untuk library MDAnalysis, terpisah dari referensi API, yang mencakup:
Panduan terperinci untuk struktur data yang digunakan dalam MDAnalysis. Halaman ini akan memperkenalkan kelas Atom, AtomGroup, dan Universe; termasuk opsi I/O; dan berisi informasi tentang cara memanipulasi Atom dan menggabungkan AtomGroups.
Halaman di elemen penyusun Analisis. Class AnalysisBase, class AnalysisFromFunction, dan fungsi analysis_class membentuk dasar dari setiap analisis yang ditentukan pengguna. Apa yang dilakukan setiap class di balik layar bermanfaat untuk diketahui, misalnya jika dianalogikan dengan numpy.vectorize.
Halaman tentang cara memilih grup atom menggunakan Universe.select_atoms. Baik detail teknis maupun pengetahuan dinamika molekul di balik cara penerapannya.
Halaman tentang topologi. Pengguna harus memahami struktur data, penggunaan, manipulasi, dan kerangka kerja untuk membangun sistem.
Halaman tentang metode visualisasi yang tersedia, untuk lintasan dan analisis saat ini yang mengembalikan data untuk visualisasi.