Proyek MDAnalysis
Tetap teratur dengan koleksi
Simpan dan kategorikan konten berdasarkan preferensi Anda.
Halaman ini berisi detail project penulisan teknis yang diterima untuk
Google Season of Docs.
Ringkasan project
- Organisasi open source:
- MDAnalysis
- Penulis teknis:
- lilyminium
- Nama project:
- Panduan pengguna disusun berdasarkan topik
- Durasi project:
- Berjalan lama (5 bulan)
Project description
Panduan untuk library MDAnalysis, terpisah dari referensi API, yang menyertakan:
Panduan mendetail untuk struktur data yang digunakan dalam MDAnalysis. Halaman ini akan memperkenalkan class Atom, AtomGroup, dan Universe; menyertakan opsi I/O; dan berisi informasi tentang cara memanipulasi Atom dan menggabungkan AtomGroup.
Halaman di elemen penyusun Analisis. Class AnalysisBase, class AnalysisFromFunction, dan fungsi analysis_class membentuk dasar dari setiap analisis yang ditetapkan pengguna. Apa yang dilakukan setiap kelas di balik layar adalah hal yang patut diketahui, misalnya apakah itu sama dengan numpy.vectorize.
Halaman tentang pemilihan kelompok atom menggunakan Universe.select_atoms. Detail teknis dan pengetahuan dinamika molekuler di balik cara penerapannya.
Halaman tentang topologi. Pengguna harus memahami struktur, penggunaan, manipulasi, dan framework data untuk membuat sistem.
Halaman tentang metode visualisasi yang tersedia, baik untuk lintasan maupun untuk analisis saat ini yang menampilkan data untuk visualisasi.
Kecuali disebutkan lain, konten di halaman ini dilisensikan berdasarkan Lisensi Creative Commons Attribution 4.0. Untuk mengetahui informasi selengkapnya, lihat Kebijakan Situs Google Developers. Java adalah merek dagang terdaftar dari Oracle dan/atau afiliasinya.
Terakhir diperbarui pada 2024-11-08 UTC.
[[["Mudah dipahami","easyToUnderstand","thumb-up"],["Memecahkan masalah saya","solvedMyProblem","thumb-up"],["Lainnya","otherUp","thumb-up"]],[["Informasi yang saya butuhkan tidak ada","missingTheInformationINeed","thumb-down"],["Terlalu rumit/langkahnya terlalu banyak","tooComplicatedTooManySteps","thumb-down"],["Sudah usang","outOfDate","thumb-down"],["Masalah terjemahan","translationIssue","thumb-down"],["Masalah kode / contoh","samplesCodeIssue","thumb-down"],["Lainnya","otherDown","thumb-down"]],["Terakhir diperbarui pada 2024-11-08 UTC."],[[["This project aims to create a comprehensive user guide for the MDAnalysis library, focusing on topics like data structures, analysis tools, atom selection, topologies, and visualization methods."],["The guide will provide detailed explanations of key MDAnalysis classes such as Atom, AtomGroup, Universe, and AnalysisBase, along with practical examples of their usage."],["This long-running project will complement the existing API reference by offering a more user-friendly and topic-oriented approach to understanding MDAnalysis."],["It will empower users to effectively utilize the library for molecular dynamics analysis by providing clear guidance on data manipulation, analysis customization, and visualization techniques."]]],["The core of this project involves creating a user guide for the MDAnalysis library. This guide will include detailed explanations of MDAnalysis data structures like Atom, AtomGroup, and Universe, covering I/O and manipulation. It will detail the underlying AnalysisBase and AnalysisFromFunction classes, alongside `Universe.select_atoms` functionality. The project also covers topologies, focusing on structure, usage, and system construction. Lastly, it will detail trajectory and analysis data visualization methods.\n"]]
