Dự án NRNB

Trang này chứa thông tin chi tiết về một dự án viết kỹ thuật được chấp nhận cho Google Phần Tài liệu.

Tóm tắt dự án

Tổ chức nguồn mở:
Tài nguyên quốc gia về sinh học mạng (NRNB)
Người viết nội dung kỹ thuật:
kozo2
Tên dự án:
Thay thế các hướng dẫn điều khiển GUI thành Jupyter Notebook và R Markdown
Thời lượng dự án:
Thời lượng tiêu chuẩn (3 tháng)

Mô tả dự án

Các hướng dẫn tại https://github.com/cytoscape/cytoscape-tutorials/wiki rất tuyệt, nhưng hầu hết trong số đó đều dựa trên GUI và không được tự động hoá bằng Python hoặc R.

Tôi sẽ viết nội dung của hướng dẫn về Cytoscape bằng cả Python và R càng nhiều càng tốt, đồng thời tạo trang web thư viện Jupyter Notebook và R Markdown. Các trang web đó sẽ có thiết kế tương tự như https://plot.ly/ipython-notebooks/https://rmarkdown.rstudio.com/gallery.html.

Để duy trì tính nhất quán của nội dung mới, tôi sẽ sử dụng các dịch vụ của CI và https://github.com/cytoscape/docker-cytoscape-desktop (tức là tự động chạy Máy tính xách tay Jupyter và R Markdown).