NRNB projesi

Bu sayfa, Google Dokümanlar Sezonu için kabul edilen teknik yazı projesinin ayrıntılarını içerir.

Proje özeti

Açık kaynak kuruluşu:
Ağ Biyolojisi İçin Ulusal Kaynak (NRNB)
Teknik yazar:
kozo2
Proje adı:
GUI kontrolü eğiticilerini Jupyter Notebook ve R Markdown ile değiştirme
Proje süresi:
Standart uzunluk (3 ay)

Proje açıklaması

https://github.com/cytoscape/cytoscape-tutorials/wiki adresindeki eğiticiler harika olsa da çoğu GUI tabanlı olup Python veya R dilinde otomatik olarak gerçekleştirilmez.

Cytoscape eğitimlerinin içeriğini mümkün olduğunca Python ve R dilinde yazacağım ve Jupyter Notebook ve R Markdown galerisi sitesi yapacağım. Bu sitelerin tasarımı https://plot.ly/ipython-notebooks/ ve https://rmarkdown.rstudio.com/gallery.html şeklinde görünür.

Yeni içeriğin tutarlılığını korumak için CI hizmetlerini ve https://github.com/cytoscape/docker-cytoscape-desktop yöntemini (ör. Jupyter Notebook ve R Markdown'ın otomatik olarak çalıştırılması) kullanacağım.