โครงการ NRNB

หน้านี้มีรายละเอียดของโครงการเขียนเชิงเทคนิคที่ยอมรับใน Google Season of Docs

ข้อมูลสรุปของโปรเจ็กต์

องค์กรโอเพนซอร์ส:
แหล่งข้อมูลชีววิทยาเครือข่ายแห่งชาติ (NRNB)
ผู้เขียนด้านเทคนิค:
kozo2
ชื่อโปรเจ็กต์:
การแทนที่บทแนะนำการควบคุม GUI เป็น Jupyter Notebook และ R Markdown
ระยะเวลาของโปรเจ็กต์:
ระยะเวลามาตรฐาน (3 เดือน)

คำอธิบายโปรเจ็กต์

บทแนะนำที่ https://github.com/cytoscape/cytoscape-tutorials/wiki มีประโยชน์ แต่ส่วนใหญ่เป็นแบบ GUI และไม่ได้ทำงานอัตโนมัติใน Python หรือ R

ผมจะเขียนเนื้อหาบทแนะนำ Cytoscape ทั้งใน Python และ R ให้มากที่สุดเท่าที่จะเป็นไปได้ และสร้างเว็บไซต์แกลเลอรี Jupyter Notebook และ R Markdown การออกแบบเว็บไซต์เหล่านั้นจะมีลักษณะคล้ายกับ https://plot.ly/ipython-notebooks/ และ https://rmarkdown.rstudio.com/gallery.html

เพื่อให้เนื้อหาใหม่สอดคล้องกัน ฉันจะใช้บริการ CI และ https://github.com/cytoscape/docker-cytoscape-desktop (เช่น เรียกใช้ Jupyter Notebook และ R Markdown แบบอัตโนมัติ)