NRNB プロジェクト

このページには、Google シーズンの Google ドキュメントで承認されたテクニカル ライティング プロジェクトの詳細が記載されています。

プロジェクトの概要

オープンソースの組織:
National Resource for Network Biology(NRNB)
テクニカル ライター:
kozo2
プロジェクト名:
GUI コントロール チュートリアルを Jupyter Notebook と R Markdown に変更
プロジェクトの期間:
標準の長さ(3 か月)

プロジェクトの説明

https://github.com/cytoscape/cytoscape-tutorials/wiki のチュートリアルも優れていますが、ほとんどは GUI ベースであり、Python や R では自動化されていません。

Cytoscape のチュートリアルの内容をできるだけ Python と R で記述し、Jupyter Notebook と R Markdown のギャラリー サイトを作成します。 これらのサイトのデザインは、https://plot.ly/ipython-notebooks/https://rmarkdown.rstudio.com/gallery.html のようになります。

新しいコンテンツの整合性を維持するために、CI サービスと https://github.com/cytoscape/docker-cytoscape-desktopを使用します(つまり、Jupyter Notebook と R Markdown の実行を自動化します)。