Halaman ini berisi detail proyek penulisan teknis yang diterima untuk Google Season of Dokumen.
Ringkasan proyek
- Organisasi open source:
- National Resource for Network Biology (NRNB)
- Penulis teknis:
- kozo2
- Nama proyek:
- Mengganti tutorial kontrol GUI ke Jupyter Notebook dan R Markdown
- Durasi proyek:
- Durasi standar (3 bulan)
Project description
Tutorial di https://github.com/cytoscape/cytoscape-tutorials/wiki sudah sangat bagus, tetapi sebagian besar tutorial tersebut berbasis GUI dan tidak otomatis di Python atau R.
Saya akan menulis isi tutorial Cytoscape di Python dan R sebanyak mungkin, dan membuat situs galeri Jupyter Notebook dan R Markdown. Desain situs tersebut akan terlihat seperti https://plot.ly/ipython-notebooks/ dan https://rmarkdown.rstudio.com/gallery.html.
Untuk mempertahankan konsistensi konten baru, saya akan menggunakan layanan CI dan https://github.com/cytoscape/docker-cytoscape-desktop (yaitu mengotomatiskan proses menjalankan Jupyter Notebook dan R Markdown).