Cette page contient les détails d'un projet de rédaction technique accepté pour Google Season of Docs.
Résumé du projet
- Organisation Open Source:
- National Resource for Network Biology (NRNB)
- Rédacteur technique:
- kozo2
- Nom du projet:
- Remplacer les tutoriels de contrôle de l'IUG par les notebooks Jupyter et R Markdown
- Durée du projet:
- Durée standard (3 mois)
Project description
Les tutoriels disponibles à l'adresse https://github.com/cytoscape/cytoscape-tutorials/wiki sont excellents, mais la plupart d'entre eux sont basés sur une IUG et ne sont pas automatisés en Python ni en R.
Dans la mesure du possible, j'écrirai le contenu des tutoriels Cytoscape dans Python et R, et je créerai le site de la galerie Jupyter Notebook et R Markdown. Ces sites se présentent comme suit : https://plot.ly/ipython-notebooks/ et https://rmarkdown.rstudio.com/gallery.html.
Pour maintenir la cohérence du nouveau contenu, j'utiliserai les services CI et https://github.com/cytoscape/docker-cytoscape-desktop (c'est-à-dire, j'automatiserai l'exécution du notebook Jupyter et de R Markdown).