Esta página contiene los detalles de un proyecto de redacción técnico aceptado para Google Season of Docs.
Resumen del proyecto
- Organización de código abierto:
- Recurso Nacional de Biología de Redes (NRNB)
- Redactor técnico:
- kozo2
- Nombre del proyecto:
- Reemplazar los instructivos de control de la GUI por el notebook de Jupyter y R Markdown
- Duración del proyecto:
- Duración estándar (3 meses)
Project description
Los instructivos en https://github.com/cytoscape/cytoscape-tutorials/wiki son geniales, pero la mayoría de ellos están basados en GUI y no están automatizados en Python o R.
Escribiré el contenido de los tutoriales de Cytoscape en Python y R lo más posible, y haré el sitio de la galería de R Markdown y el notebook de Jupyter. El diseño de esos sitios se verá de la siguiente manera: https://plot.ly/ipython-notebooks/ y https://rmarkdown.rstudio.com/gallery.html.
Para mantener la coherencia del contenido nuevo, usaré servicios de CI y https://github.com/cytoscape/docker-cytoscape-desktop (es decir, automatizar la ejecución del notebook de Jupyter y R Markdown).