Dự án MDAnalysis

Trang này chứa thông tin chi tiết về một dự án viết kỹ thuật được chấp nhận cho Google Phần Tài liệu.

Tóm tắt dự án

Tổ chức nguồn mở:
MDAnalysis
Người viết nội dung kỹ thuật:
hoa lily
Tên dự án:
Một hướng dẫn sử dụng được cấu trúc theo chủ đề
Thời lượng dự án:
Sử dụng lâu dài (5 tháng)

Mô tả dự án

Hướng dẫn về thư viện MDAnalysis, tách biệt với tài liệu tham khảo API, bao gồm:

  1. Hướng dẫn chi tiết về cấu trúc dữ liệu dùng trong MDAnalysis. Trang này sẽ giới thiệu các lớp Atom, AtomGroup và Universal, bao gồm các tùy chọn I/O; và chứa thông tin về các thao tác Atom và kết hợp AtomGroups.

  2. Một trang trên các thành phần của công cụ Phân tích. Các lớp AnalysisBase, lớp AnalysisFromFunction và các hàm Analysis_class là cơ sở của mọi bản phân tích do người dùng xác định. Về bản chất, mỗi lớp đều rất đáng để tìm hiểu, ví dụ: liệu lớp đó có tương tự với numpy.vectơ hoá hay không.

  3. Một trang về cách chọn các nhóm nguyên tử bằng cách sử dụng Universal.select_atoms. Cả chi tiết kỹ thuật và kiến thức về động lực phân tử đằng sau cách thức triển khai này.

  4. Một trang về các cấu trúc liên kết. Người dùng cần phải nắm được cấu trúc dữ liệu, cách sử dụng, thao tác và khung dữ liệu để xây dựng hệ thống.

  5. Một trang về các phương pháp trực quan hoá có sẵn, cho cả quỹ đạo và các bản phân tích hiện tại, trong đó trả về dữ liệu để trực quan hoá.