Dự án MDAnalysis
Sử dụng bộ sưu tập để sắp xếp ngăn nắp các trang
Lưu và phân loại nội dung dựa trên lựa chọn ưu tiên của bạn.
Trang này chứa thông tin chi tiết về một dự án viết nội dung kỹ thuật đã được chấp nhận tham gia Google Season of Docs.
Tóm tắt dự án
- Tổ chức nguồn mở:
- MDAnalysis
- Người viết nội dung kỹ thuật:
- lilyminium
- Tên dự án:
- Hướng dẫn sử dụng được sắp xếp theo chủ đề
- Thời lượng dự án:
- Chạy trong thời gian dài (5 tháng)
Mô tả dự án
Hướng dẫn về thư viện MDAnalysis, tách biệt với tài liệu tham khảo API, bao gồm:
Hướng dẫn chi tiết về các cấu trúc dữ liệu được sử dụng trong MDAnalysis. Trang này sẽ giới thiệu các lớp Atom, AtomGroup và Universe; bao gồm các tuỳ chọn I/O; và chứa thông tin về cách thao tác với Atom và kết hợp AtomGroup.
Trang về các thành phần phân tích. Lớp AnalysisBase, lớp AnalysisFromFunction và các hàm analysis_class là nền tảng của mọi hoạt động phân tích do người dùng xác định. Bạn nên biết những gì mỗi lớp thực hiện, ví dụ: nếu lớp đó tương tự như numpy.vectorize.
Trang về cách chọn nhóm nguyên tử bằng Universe.select_atoms. Cả thông tin kỹ thuật và kiến thức về động lực học phân tử đằng sau cách triển khai phương pháp này.
Một trang về lời xin lỗi. Người dùng phải nắm được cấu trúc dữ liệu, cách sử dụng, thao tác và khung làm việc để xây dựng hệ thống.
Trang về các phương pháp trực quan hoá hiện có, cả cho quỹ đạo và cho các phân tích hiện tại trả về dữ liệu để trực quan hoá.
Trừ phi có lưu ý khác, nội dung của trang này được cấp phép theo Giấy phép ghi nhận tác giả 4.0 của Creative Commons. Để biết thông tin chi tiết, vui lòng tham khảo Chính sách trang web của Google Developers. Java là nhãn hiệu đã đăng ký của Oracle và/hoặc các đơn vị liên kết với Oracle.
Cập nhật lần gần đây nhất: 2024-11-08 UTC.
[[["Dễ hiểu","easyToUnderstand","thumb-up"],["Giúp tôi giải quyết được vấn đề","solvedMyProblem","thumb-up"],["Khác","otherUp","thumb-up"]],[["Thiếu thông tin tôi cần","missingTheInformationINeed","thumb-down"],["Quá phức tạp/quá nhiều bước","tooComplicatedTooManySteps","thumb-down"],["Đã lỗi thời","outOfDate","thumb-down"],["Vấn đề về bản dịch","translationIssue","thumb-down"],["Vấn đề về mẫu/mã","samplesCodeIssue","thumb-down"],["Khác","otherDown","thumb-down"]],["Cập nhật lần gần đây nhất: 2024-11-08 UTC."],[[["This project aims to create a comprehensive user guide for the MDAnalysis library, focusing on topics like data structures, analysis tools, atom selection, topologies, and visualization methods."],["The guide will provide detailed explanations of key MDAnalysis classes such as Atom, AtomGroup, Universe, and AnalysisBase, along with practical examples of their usage."],["This long-running project will complement the existing API reference by offering a more user-friendly and topic-oriented approach to understanding MDAnalysis."],["It will empower users to effectively utilize the library for molecular dynamics analysis by providing clear guidance on data manipulation, analysis customization, and visualization techniques."]]],["The core of this project involves creating a user guide for the MDAnalysis library. This guide will include detailed explanations of MDAnalysis data structures like Atom, AtomGroup, and Universe, covering I/O and manipulation. It will detail the underlying AnalysisBase and AnalysisFromFunction classes, alongside `Universe.select_atoms` functionality. The project also covers topologies, focusing on structure, usage, and system construction. Lastly, it will detail trajectory and analysis data visualization methods.\n"]]
