Projeto MDAnalysis
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Esta página contém os detalhes de um projeto de escrita técnica aceito para o Temporada dos Documentos Google.
Resumo do projeto
- Organização de código aberto:
- MDAnalysis
- Redator técnico:
- lírio
- Nome do projeto:
- Um guia do usuário estruturado por tópico
- Duração do projeto:
- Longa duração (cinco meses)
Project description
Um guia da biblioteca MDAnalysis, separado da referência da API, que inclui:
Um guia detalhado sobre as estruturas de dados usadas na MDAnalysis. Esta página vai apresentar as classes Atom, AtomGroup e Universe, incluir opções de E/S e conter informações sobre como manipular átomos e combinar AtomGroups.
Uma página sobre os elementos básicos do Analysis. As classes AnalysisBase, AnalysisFromFunction e analysis_class formam a base de qualquer análise definida pelo usuário. Vale a pena saber o que cada classe faz, por exemplo, se ela é análoga a numpy.vectorize.
Uma página sobre como selecionar grupos de átomos usando Universe.select_atoms. Tanto os detalhes técnicos quanto o conhecimento sobre dinâmica molecular por trás da implementação.
Uma página sobre topologias. Os usuários precisam entender a estrutura, o uso, a manipulação e a estrutura de dados para a construção de sistemas.
Uma página sobre os métodos de visualização disponíveis, tanto para a trajetória quanto para as análises atuais que retornam dados para visualização.
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Última atualização 2025-07-25 UTC.
[[["Fácil de entender","easyToUnderstand","thumb-up"],["Meu problema foi resolvido","solvedMyProblem","thumb-up"],["Outro","otherUp","thumb-up"]],[["Não contém as informações de que eu preciso","missingTheInformationINeed","thumb-down"],["Muito complicado / etapas demais","tooComplicatedTooManySteps","thumb-down"],["Desatualizado","outOfDate","thumb-down"],["Problema na tradução","translationIssue","thumb-down"],["Problema com as amostras / o código","samplesCodeIssue","thumb-down"],["Outro","otherDown","thumb-down"]],["Última atualização 2025-07-25 UTC."],[],["The core of this project involves creating a user guide for the MDAnalysis library. This guide will include detailed explanations of MDAnalysis data structures like Atom, AtomGroup, and Universe, covering I/O and manipulation. It will detail the underlying AnalysisBase and AnalysisFromFunction classes, alongside `Universe.select_atoms` functionality. The project also covers topologies, focusing on structure, usage, and system construction. Lastly, it will detail trajectory and analysis data visualization methods.\n"]]
