Projekt MDAnalysis
Zadbaj o dobrą organizację dzięki kolekcji
Zapisuj i kategoryzuj treści zgodnie ze swoimi preferencjami.
Ta strona zawiera szczegółowe informacje o projekcie polegającym na pisaniu tekstów technicznych, który został zaakceptowany w ramach Google Season of Docs.
Podsumowanie projektu
- Organizacja open source:
- MDAnalysis
- Pisarz techniczny:
- lilyminium
- Nazwa projektu:
- Przewodnik użytkownika uporządkowany według tematu
- Długość projektu:
- Długotrwałe (5 miesięcy)
Opis projektu
Przewodnik po bibliotece MDAnalysis, oddzielny od dokumentacji interfejsu API, który zawiera:
Szczegółowy przewodnik po strukturach danych używanych w metodzie MDAnalysis. Na tej stronie znajdziesz informacje o klasach Atom, AtomGroup i Universe, opcje wejścia/wyjścia oraz informacje o modyfikowaniu atomów i łączeniu grup atomów.
Strona dotycząca elementów składowych analizy. Funkcje klasy AnalysisBase, AnalysisFromFunction i Analysis_class stanowią podstawę każdej analizy zdefiniowanej przez użytkownika. Warto wiedzieć, co każda klasa robi pod spodem, np. czy jest analogiczna do numpy.vectorize.
Strona dotycząca wybierania grup atomów za pomocą funkcji Universe.select_atoms. Zarówno szczegóły techniczne, jak i wiedza na temat dynamiki molekularnej, która leży u podłoża tego rozwiązania.
Strona o topologiach. Użytkownicy powinni znać strukturę danych, wykorzystanie, możliwości manipulacji i strukturę danych do tworzenia systemów.
Strona z dostępnymi metodami wizualizacji, zarówno dla trajektorii, jak i dla bieżących analiz, które zwracają dane do wizualizacji.
O ile nie stwierdzono inaczej, treść tej strony jest objęta licencją Creative Commons – uznanie autorstwa 4.0. Szczegółowe informacje na ten temat zawierają zasady dotyczące witryny Google Developers. Java jest zastrzeżonym znakiem towarowym firmy Oracle i jej podmiotów stowarzyszonych.
Ostatnia aktualizacja: 2025-07-25 UTC.
[[["Łatwo zrozumieć","easyToUnderstand","thumb-up"],["Rozwiązało to mój problem","solvedMyProblem","thumb-up"],["Inne","otherUp","thumb-up"]],[["Brak potrzebnych mi informacji","missingTheInformationINeed","thumb-down"],["Zbyt skomplikowane / zbyt wiele czynności do wykonania","tooComplicatedTooManySteps","thumb-down"],["Nieaktualne treści","outOfDate","thumb-down"],["Problem z tłumaczeniem","translationIssue","thumb-down"],["Problem z przykładami/kodem","samplesCodeIssue","thumb-down"],["Inne","otherDown","thumb-down"]],["Ostatnia aktualizacja: 2025-07-25 UTC."],[],["The core of this project involves creating a user guide for the MDAnalysis library. This guide will include detailed explanations of MDAnalysis data structures like Atom, AtomGroup, and Universe, covering I/O and manipulation. It will detail the underlying AnalysisBase and AnalysisFromFunction classes, alongside `Universe.select_atoms` functionality. The project also covers topologies, focusing on structure, usage, and system construction. Lastly, it will detail trajectory and analysis data visualization methods.\n"]]
