פרויקט MD Analysis
קל לארגן דפים בעזרת אוספים
אפשר לשמור ולסווג תוכן על סמך ההעדפות שלך.
בדף הזה מפורטים פרטי פרויקט של כתיבה טכנית שאושר להשתתפות בתוכנית Google Season of Docs.
סיכום הפרויקט
- ארגון קוד פתוח:
- MDAnalysis
- כותבים טכניים:
- lilyminium
- שם הפרויקט:
- מדריך למשתמש שמאורגן לפי נושא
- אורך הפרויקט:
- ריצה ארוכה (5 חודשים)
תיאור הפרויקט
מדריך לספריית MDAnalysis, נפרד מהמדריך ל-API, שכולל:
מדריך מפורט לגבי מבני הנתונים שבהם נעשה שימוש ב-MDAnalysis. הדף הזה יציג את המחלקות Atom, AtomGroup ו-Universe; כולל אפשרויות קלט/פלט (I/O) ומכיל מידע על טיפול ב-Atom ושילוב של קבוצות Atom.
דף בנושא אבני הבניין של Analytics. המחלקה AnalysisBase, מחלקה AnalysisFromFunction ו-analytics_class מהווים את הבסיס לכל ניתוח בהגדרת המשתמש. כדאי לדעת מה כל כיתה עושה מתחת לפני השטח, למשל אם היא דומה ל-numpy.vectorize.
דף בנושא בחירת קבוצות של אטומים באמצעות Universe.select_atoms. גם את הפרטים הטכניים וגם את הידע בנושא דינמיקה מולקולרית שמאחורי האופן שבו ההטמעה מתבצעת.
דף בטופולוגיות. המשתמשים צריכים להבין את מבנה הנתונים, את השימוש בהם, את האופן שבו אפשר לשנות אותם ואת המסגרת ליצירת מערכות.
דף עם שיטות זמינות להצגה חזותית, גם של המסלול וגם של הניתוחים הנוכחיים שמחזירים נתונים להצגה חזותית.
אלא אם צוין אחרת, התוכן של דף זה הוא ברישיון Creative Commons Attribution 4.0. לפרטים, ניתן לעיין במדיניות האתר Google Developers. Java הוא סימן מסחרי רשום של חברת Oracle ו/או של השותפים העצמאיים שלה.
עדכון אחרון: 2025-07-25 (שעון UTC).
[[["התוכן קל להבנה","easyToUnderstand","thumb-up"],["התוכן עזר לי לפתור בעיה","solvedMyProblem","thumb-up"],["סיבה אחרת","otherUp","thumb-up"]],[["חסרים לי מידע או פרטים","missingTheInformationINeed","thumb-down"],["התוכן מורכב מדי או עם יותר מדי שלבים","tooComplicatedTooManySteps","thumb-down"],["התוכן לא עדכני","outOfDate","thumb-down"],["בעיה בתרגום","translationIssue","thumb-down"],["בעיה בדוגמאות/בקוד","samplesCodeIssue","thumb-down"],["סיבה אחרת","otherDown","thumb-down"]],["עדכון אחרון: 2025-07-25 (שעון UTC)."],[],["The core of this project involves creating a user guide for the MDAnalysis library. This guide will include detailed explanations of MDAnalysis data structures like Atom, AtomGroup, and Universe, covering I/O and manipulation. It will detail the underlying AnalysisBase and AnalysisFromFunction classes, alongside `Universe.select_atoms` functionality. The project also covers topologies, focusing on structure, usage, and system construction. Lastly, it will detail trajectory and analysis data visualization methods.\n"]]
