MDAnalyseprojekt
Mit Sammlungen den Überblick behalten
Sie können Inhalte basierend auf Ihren Einstellungen speichern und kategorisieren.
Auf dieser Seite finden Sie die Details zu einem Projekt für technisches Schreiben, das für Google Season of Docs angenommen wurde.
Projektzusammenfassung
- Open-Source-Organisation:
- MDAnalysis
- Technischer Redakteur:
- lilyminium
- Projektname:
- Ein nach Themen strukturierter Leitfaden
- Projektlänge:
- Lang andauernd (5 Monate)
Projektbeschreibung
Ein Leitfaden zur MDAnalysis-Bibliothek, der unabhängig von der API-Referenz ist und Folgendes enthält:
Eine detaillierte Anleitung zu den in MDAnalysis verwendeten Datenstrukturen. Auf dieser Seite werden die Klassen „Atom“, „AtomGroup“ und „Universe“ vorgestellt. Außerdem finden Sie Informationen zu I/O-Optionen und zur Manipulation von Atomen und zum Kombinieren von Atomgruppen.
Eine Seite zu den Analysebausteinen. Die Klassen „AnalysisBase“, „AnalysisFromFunction“ und die Funktionen „analysis_class“ bilden die Grundlage jeder benutzerdefinierten Analyse. Es ist hilfreich zu wissen, was jede Klasse im Hintergrund tut, z.B. ob sie analog zu numpy.vectorize ist.
Eine Seite zum Auswählen von Atomgruppen mit Universe.select_atoms. Sowohl die technischen Details als auch die Kenntnisse der molekularen Dynamik, die hinter der Implementierung stehen.
Eine Seite zu Topologien. Nutzer sollten die Datenstruktur, die Verwendung, die Manipulation und das Framework zum Erstellen von Systemen verstehen.
Eine Seite mit verfügbaren Visualisierungsmethoden, sowohl für die Flugbahn als auch für aktuelle Analysen, die Daten für die Visualisierung zurückgeben.
Sofern nicht anders angegeben, sind die Inhalte dieser Seite unter der Creative Commons Attribution 4.0 License lizenziert. Weitere Informationen finden Sie in den Websiterichtlinien von Google Developers. Java ist eine eingetragene Marke von Oracle und/oder seinen Partnern.
Zuletzt aktualisiert: 2025-07-25 (UTC).
[[["Leicht verständlich","easyToUnderstand","thumb-up"],["Mein Problem wurde gelöst","solvedMyProblem","thumb-up"],["Sonstiges","otherUp","thumb-up"]],[["Benötigte Informationen nicht gefunden","missingTheInformationINeed","thumb-down"],["Zu umständlich/zu viele Schritte","tooComplicatedTooManySteps","thumb-down"],["Nicht mehr aktuell","outOfDate","thumb-down"],["Problem mit der Übersetzung","translationIssue","thumb-down"],["Problem mit Beispielen/Code","samplesCodeIssue","thumb-down"],["Sonstiges","otherDown","thumb-down"]],["Zuletzt aktualisiert: 2025-07-25 (UTC)."],[],["The core of this project involves creating a user guide for the MDAnalysis library. This guide will include detailed explanations of MDAnalysis data structures like Atom, AtomGroup, and Universe, covering I/O and manipulation. It will detail the underlying AnalysisBase and AnalysisFromFunction classes, alongside `Universe.select_atoms` functionality. The project also covers topologies, focusing on structure, usage, and system construction. Lastly, it will detail trajectory and analysis data visualization methods.\n"]]
